ISA(개인종합자산관리계좌)는 예금, 펀드, 주식 등 다양한 금융상품을 한 계좌에서 운용하면서 비과세 및 절세 혜택을 받을 수 있는 절세형 계좌입니다. 특히 주식 매도 시 발생한 수익은 일반 계좌와 달리 일정 한도 내에서는 비과세, 초과분은 분리과세(9%)로 적용됩니다.
이번 글에서는 “ISA 계좌에서 주식을 팔면 세금을 얼마나 내는지”를 최신 세법 기준에 따라 분석하고, 절세 전략까지 함께 정리합니다.
목차

1. ISA 계좌란? — 기본 개념과 가입 조건
ISA(Individual Savings Account)는 정부가 개인의 재산 형성을 돕기 위해 만든 절세형 종합 투자 계좌입니다. 예금, 펀드, ETF, 주식 등 다양한 상품을 하나의 계좌에서 관리할 수 있으며, 일정 기간(3~5년) 유지 시 세금 혜택을 받을 수 있습니다.
ISA의 가장 큰 장점은 비과세 한도 내 절세로, 초과분 역시 9% 분리과세로 일반 과세보다 유리합니다.
2. ISA 계좌에서 주식 매도 시 세금 구조
ISA 계좌에서는 주식을 매도해도 즉시 세금이 부과되지 않습니다.
모든 손익은 계좌 내에서 합산되어, 만기 시점에 한 번만 과세됩니다.
수익과 손실이 상계되므로 손해가 있을 경우 세금을 줄일 수 있습니다.

3. 비과세 한도 및 분리과세 기준
| 구분 | 비과세 한도 | 분리과세 세율 |
|---|---|---|
| 일반형 ISA | 200만 원 | 9% |
| 서민형·농어민형 ISA | 400만 원 | 9% |
예를 들어 300만 원 수익이 발생했다면, 200만 원은 비과세, 초과분 100만 원에 대해서만 9% 세율이 적용됩니다.
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4. ISA 계좌별(신탁형·중개형) 세금 차이
| 구분 | 운용 방식 | 투자 가능 상품 |
|---|---|---|
| 신탁형 ISA | 금융기관이 운용 | 예금, 펀드 중심 |
| 중개형 ISA | 투자자가 직접 운용 | 주식, ETF 등 |
5. 중도 해지 시 세금 처리 방법
ISA 계좌는 3년 이상 유지해야 세제 혜택을 받을 수 있습니다.
만기 전에 해지할 경우, 기존의 비과세 혜택이 취소되어 일반 과세(15.4%)가 적용됩니다.
단, 사망·해외이주 등의 불가피한 경우는 예외입니다.
6. ISA 계좌 절세 팁 및 수익 실현 전략
- ETF나 채권형 상품 비중을 높여 절세 효과를 극대화하는 것이 좋습니다.
- 비과세 한도를 초과할 경우에도 9% 분리과세는 여전히 유리합니다.
- ISA 만기 후 재투자 전략을 통해 복리 효과를 높이는 것이 좋습니다.
- 부부가 각각 ISA를 개설하면 비과세 한도를 2배로 활용할 수 있습니다.
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7. ISA 세금 계산 예시표
| 구분 | 총 수익금 | 비과세 한도 | 과세 대상 | 세율 | 납부 세금 |
|---|---|---|---|---|---|
| 일반형 ISA | 350만 원 | 200만 원 | 150만 원 | 9% | 13,500원 |
8. ISA 계좌 vs 일반 투자 계좌 비교
ISA는 일반 계좌보다 세제 혜택이 뛰어나며, 장기 투자 시 절세 효과가 극대화됩니다.
| 항목 | ISA 계좌 | 일반 계좌 |
|---|---|---|
| 과세 구조 | 비과세 + 9% 분리과세 | 15.4% 일반 과세 |
| 과세 시점 | 만기 시점 | 즉시 과세 |
9. 2025년 ISA 제도 변경사항
- 비과세 한도 확대 검토가 마무리 단계에 있음 (2026년부터 적용 예상)
- 해외 ETF 등 투자 가능 범위 확대
- 만기 후 자동 재가입 기능 2025년 하반기부터 도입

10. ISA 계좌 관련 자주 묻는 질문(FAQ)
Q1. ISA 계좌로 해외 ETF를 살 수 있나요?
일부 증권사에서는 가능합니다. 단, 중개형 ISA만 해당되며, 거래 가능한 종목은 제한됩니다.
Q2. ISA 계좌 수익금은 언제 인출되나요?
만기 시 일괄 인출이 원칙입니다. 중도 인출 시 세제 혜택이 사라질 수 있습니다.
Q3. 중도 해지 시 손실이 있어도 세금이 부과되나요?
손실이라면 세금은 없습니다. 단, 이익이 있을 경우 일반 과세(15.4%)가 적용됩니다.
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11. 결론 : ISA 활용으로 절세와 투자 효율을 높이자
ISA 계좌는 단순한 절세 수단이 아니라 세금 효율을 극대화하는 투자 플랫폼입니다.
2025년 세법 개정 이후 ISA 제도가 전면 개선되어 비과세 한도 상향과 해외 ETF 등 투자 범위 확대가 시행 중입니다.
지금부터 ISA를 꾸준히 활용한다면, 세금 절감과 복리 수익을 동시에 누릴 수 있습니다.